申请万元版发票通常需要遵循以下步骤：
填写防伪税控最大开票限额变更申请审批表。
准备大额销售合同及其复印件。
提供履行合同的证明材料。
如果是增值税专用发票，还需提供《行政许可表》和《最高开票限额申请表》。
将上述材料提交至主管税务机关。
确保所有手续齐全、填写内容准确，并符合受理条件。
税务机关在收到申请后，若材料齐全且符合要求，将当场受理。
涉税事项通常在受理之日起最长20个工作日内办结，部分情况下五个工作日内可在国税网查询办理进度。
在申请过程中，可以继续正常使用当前额度的发票，无需缴销或作废。
首次申请万元版发票可能需要提供额外的资料，如税务登记证副本、法人身份证、财务上岗证复印件等。
根据当地税务局的具体要求，可能还会有其他额外的要求或步骤。
请根据您所在地区的具体规定和流程进行操作，并咨询当地税务机关以获得最准确的信息。