肇事司机在交通事故中应负的责任主要包括以下几方面：
肇事司机需赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。
若造成残疾，还需赔偿辅助器具费和残疾赔偿金。
若造成死亡，则需赔偿丧葬费和死亡赔偿金，具体责任比例依据事故责任认定。
若肇事行为构成交通肇事罪，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，肇事司机可能面临三年以下有期徒刑或拘役。
肇事司机若肇事后逃逸或有其他特别恶劣情节，将面临三年以上七年以下有期徒刑。
因逃逸致人死亡的，将面临七年以上有期徒刑。
肇事司机若存在违章行为，需接受相应的行政处罚，如罚款、吊销机动车驾驶证等。
若驾驶员在执行单位工作任务过程中发生交通事故，且不存在故意或重大过失，则赔偿责任由其所在单位承担。
若驾驶员存在故意或重大过失，单位在承担赔偿责任后，可向驾驶员追偿部分或全部费用。
综上所述，肇事司机在交通事故中需承担民事、刑事和行政责任，具体责任依据事故性质、责任认定及后续行为等因素综合判断。建议肇事司机在发生事故后，立即报警并配合交警处理，以减轻可能承担的法律责任。